Al año de haber asumido la gobernación por segunda vez, Greg Abbott tuvo que enfrentar la pandemia de COVID-19 , que se extendió con rapidez por el estado. Luego, levantó el mandato de uso obligatorio de mascarillas, una decisión que dividió opiniones.

El primer caso de contagio de coronavirus en Texas apareció en febrero de 2020 y el estado registró 2,4 millones de casos, con 90.000 fallecidos para 2022. A comienzos de 2024, los registros acumulados superaban los 9 millones de casos confirmados y probables.

El 2 de abril de 2020 , el gobierno estableció la orden de quedarse en casa (stay-at-home), o cuarentena, que fue una de las más breves de todo el país, ya que terminó al finalizar el mes.

El uso obligatorio de mascarillas en espacios cerrados fue establecido en julio de 2020,

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